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解析：
「論文を書くというのは、生きたシステムとしての生き物を止めてしまうということ」、「生物学者であれば生物を題材にして論文を書く」とあるから「生きたシステムとしての生き物」とは、「生物学者が論文の題材にする生物」だとわかる。答えは2。

パターンから見ると主張は、最初になる。筆者の意見は、「現在の科学は～大きな問題なのです」（1行目～）「論文を書かなければ～評価されない」（3行目～）「論文を書くというのは～止めてしまうということ」（6行目～）の部分で第一段落と第二段落にある。つまり、「現在の科学」は「大きな問題」があり、それは、「生きたシステムとしての生き物を止めてしますということ」である。それを具体的に説明している箇所を説明の「ところがその作業を」（6行目）から「変なものなのです。」（２１行目）までの部分より探す。

    现代科学都是依靠专业的科学家来运营支撑的。事实上有个很大的问题。所谓的专业的科学家，就是写论文的人，如果是生物学家就是要写生物题材的论文。写这杨的论文是必须的。不写论文就无法承认学者的资格，更没评价。研究费不来，也干部成活儿。三样要写论文。

    但一想到经常做那作业，写论文这事，不要成为仅仅是活着的系统的生物吧。书上所载的，论文上所写的用语言罗列的就是生物，这样想的人是不存在的。因为所有生物信息化

    深切感受到这点是，病人和检查数据的不同。去医院看门诊，也会有年轻的医师。他们之中看着电脑上的画面就把检查的结果写纸上，看了MRI（核磁共振成像）或者X光的照片，连病人的脸都不看的大有人在。实际上，带年迈的母亲来看门诊的女儿就是这样抱怨的。

    “医生在诊断的过程中，连我母亲的脸一次都没见。”

    无法对待生物。生物不洁，无法预测，恐怖又复杂。但是信息化的东西就很整洁。语言也是。纸上整齐地排列着，所以也容易处理。相对病人会产生许多问题。在诊断过程中，彷徨慌张，突然发火，不顺心的地方到处都是。与之相比检查的数据又极其整齐和清洁。有时候给人一种那就是生物的错觉。到这里故事就完全逆转了。活着的东西已经是有点异常了。

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