現在の日本人の原型とされる人類は約１万８０００年くらい前、日本にやってきたと見られている。この時代は、氷河期の最も寒かった時期に当たっており、海面が現在よりも１４０ｍほど下がっていたため、当時の食料であったマンモスを追って全地球的規模で民族移動が行われ、モンゴロイドが北米、南米にも渡った時期である。

日本周辺では間宮、宗谷、津軽、対馬の各海峡や黄海、琉球列島などが陸続きになり、このため北方からは、寒い気候に適応した、顔の凹凸が少ない、身長も低い新モンゴロイドが、南方からは、アジア大陸南部に広く住んでいた丸顔の古モンゴロイドが渡ってきた。この二つはやがて混交して、やや新モンゴロイドの特徴が濃く古モンゴロイドの特徴もあわせ持つ「原日本人」が生み出された。身体的な特徴は、丸顔で、背が低い、多毛性の人種である。