日本料理を語るとき、これらの主食や副食に忘れてならないのは、調味料のしょうゆ、みそである。特にしょうゆは調味料の王様と言ってよいくらい優れたもので、つけじょうゆ、かけじょうゆ、調味にとほとんどの料理に合う。日本料理がここまで発展したのも、この醤油という調味料に負うところが大きい。

中国のしょうゆ、東南アジアの魚じょうゆもあることはあるが、これらと日本のしょうゆは味、香りともまったく異なる。みそはしょうゆほどではないが、みそ汁をはじめ、焼き物、あえ物などの調味料として重要である。